Folgende Symptome und Beschwerden können auf Gelbfieber hinweisen:

1. Phase

• Akuter Krankheitsbeginn mit hohem Fieber, Schüttelfrost
• Bradykardie – Puls mit < 60 Schlägen/min
• Cephalgie (Kopfschmerzen)
• Myalgie (Muskelschmerzen)
• Nasenbluten
• Nausea (Übelkeit)/Erbrechen 

Diese Symptome bestehen in der Regel wenige Tage. Die meisten Patienten sind danach genesen. Bei bis zu 15 % der Infizierten kommt es dann zu einer 2. Krankheitsphase.

2. Phase (toxische Phase)

• Bradykardie – Puls mit < 60 Schlägen/min
• Diarrhoe (Durchfall), blutig
• Hohes Fieber
• Ikterus (Gelbsucht)
• Kaffeesatzartiges Bluterbrechen
• Neurologische Störungen, die sich unter anderem durch Sprachstörungen, Bewegungsstörungen oder Krämpfe zeigen können
• Nierenfunktionsstörungen, die bis zur Anurie – fehlende Urinausscheidung – führen können

Daneben kann es zu Blutungen in den Organen und der Haut kommen

Insbesondere bei Kindern treten meist sehr milde Verläufe auf.
Die Erkrankung kann auch asymptomatisch verlaufen, das heißt, es treten keine Symptome auf.